对分子轨道理论而言,一般孤电子对可在价电子层的σ上可以判断：比如,对于第二周期的同核双原子分子,如O2,分子轨道排布式：O2 (16e) ：(σ1s)2 (σ*1s)2 (σ2s)2(σ*2s)2(σ2px)2 (π2py)2 (π2pz)2 (π*2py)1 ...怎么判断孤电子的对数？“孤电子对有二对：(σ2s)2(σ*2s)2”怎么的出来的？成键和反键的σ部分，一般为孤电子对：(σ2s)2 ， (σ*2s)2，这个是排出来到，分子结构部分在进一步讨论的相关知识中有介绍。其他诸如CO，N2，O2，CN-都是如此。