A、由原子直接构成的物质，原子是保持物质的化学性质的最小粒子，故A对；
B、由分子构成的物质，分子是保持物质化学性质的最小粒子，故B正确；
C、质子不能直接构成物质，更不能保持物质的化学性质，故C错；
D、电子不能直接构成物质，也不能保持物质的化学性质，故D错．
故选AB．