可以的,如果确有必要的话.
现在连电子、质子甚至中子都是可以控制的.
不过控制个别分子运动的方向和速度似乎没有多大意义,人们通常只控制分子运动的平均速度,这样就能控制温度.
现在有一种激光制冷技术,就是用激光控制分子的运动速度和方向.