草酰乙酸一般有三个来源：
1.苹果酸再生为草酰乙酸：三羧酸循环中,生成的苹果酸在脱氢酶的催化下,再生为草酰乙酸.
2.由丙酮酸生成：在羧化酶的催化下,丙酮酸生成草酰乙酸.
3.由磷酸烯醇式丙酮酸（PEP）生成：PEP在羧激酶的催化下,可生成草酰乙酸.
3.天冬氨酸生成：天冬氨酸在转氨酶的催化下,生成草酰乙酸.
去路：
1.生成天冬氨酸：在转氨酶的催化下生成天冬氨酸.
2.间接的去路：三羧酸循环中,每一分子的乙酰CoA需要一分子的草酰乙酸参与,虽然理论上草酰乙酸由苹果酸氧化后再生,但是三羧酸循环中,很多中间产物用于合成脂肪酸和氨基酸等物质,间接消耗了草酰乙酸.