细菌可根据形状分为三类,即：球菌、杆菌和螺形菌（包括弧菌、螺菌、螺杆菌）.按细菌的生活方式来分类,分为两大类：自养菌和异养菌,其中异养菌包括腐生菌和寄生菌.按细菌对氧气的需求来分类,可分为需氧（完全需氧和微需氧）和厌氧（不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧）细菌.按细菌生存温度分类,可分为喜冷、常温和喜高温三类.
但是你要说有多少种的话没法说,因为绝大多数细菌还没有深入研究.大量的菌种没有发现.