一个双链DNA分子经过三次复制以后得到的第四代DNA分子共有2³=8个，即16条链．根据DNA分子半保留复制特点，在这8个DNA分子的16条链中，只有2条链是最初的母链，还有14条链是新形成的子链．因此，在第四代DNA分子中，有2条第一代脱氧核苷酸的长链．
故选：A．