1.at the other side of,on the other side of和in the other side of三者的区别不大,个人觉得没有必要去区分.
其中,on the other side of是最标准的用法；
at the other side of是普通用法,没有特别的规定；
in the other side of更强调在其内部.
2.at the end of可以指时间上“在...末尾/快结束时”,也可以指空间上“在...尽头/末端”.
而on the end of只指空间上的“在...的尽头/末端”.
3.by the end of的意思是“到...末为止”,一般是指时间.
含有此做时间状语的句子最好用完成时态,如过去完成时（到过去某个时间点结尾为止）/现在完成时（到现在为止）/将来完成时（到将来某个时刻结束为止）.
不过,我也见过用一般时态的,如一般过去时等.此类语法叫少用,建议楼主还是用完成时态更好.