Z－DNA的形成通常在热力学上是不利的.
因为Z－DNA中带负电荷的磷酸根距离太近了,这会产生静电排斥.
但是,DNA链的局部不稳定区的存在就成为潜在的解链位点.
DNA解螺旋却是DNA复制和转录等过程中必要的环节,因此认为这一结构与基因调节有关.