细菌如果细胞壁较厚、肽聚糖网层次较多且交联致密,染色时,能把结晶紫与碘复合物牢牢留在壁内,使其呈紫色,这就是革兰氏阳性菌；细胞壁薄、外膜层类脂含量高、肽聚糖层薄且交联度差,在遇脱色剂后,以类脂为主的外膜迅速溶解,薄而松散的肽聚糖网不能阻挡结晶紫与碘复合物的溶出,因此通过乙醇脱色后仍呈无色,再经沙黄等红色染料复染,就使革兰氏阴性菌呈红色.