两个氨基酸分子脱水缩合形成二肽时，一个氨基酸上的氨基和另一个氨基酸上的羧基通过脱水缩合的方式形成肽键，即“-NH-CO-”，同时氨基上的“-H”和羧基上的“-OH”结合生成水．所以水分子中的氢来自于氨基和羧基，氧来自于羧基．
故选：B．