我国南方地区纬度较低，热量充足，降水丰沛，耕地类型是水田，主要粮食作物是水稻；我国北方地区纬度较高，热量相对不足，降水较少，耕地类型是旱地，主要粮食作物是小麦，可见造成我国南方地区和北方地区农业生产差异的最主要因素是气候．故选项A符合题意．
故选：A．