A、运载体能在宿主细胞中复制并稳定保存，A正确；
B、运载体具有多个限制酶切点，以便于外源基因连接，B正确；
C、最常用的运载体是质粒，也可以是噬菌体、动植物病毒，C错误；
D、运载体在限制酶切点外必须含有标记基因，便于筛选，D正确．
故选：C．