就给你一个情境吧
she is coming later就是“她一会就会来的”
比如A问 Is she coming?（她会来不?）
B答 she is coming later.（嗯,她一会就来的.）
She comes later就是“她一会来”而不是“她一会就会来的”
并没有十分肯定该事件的发生.
一般情况下,现在进行时比一般现在时的语气多一份肯定在里面~
他现在不在这里,一会可能会来也可能不会.我们不知道.故comes.