∵a∈A且4-a∈A，a∈N且4-a∈N，
若a=0，则4-a=4，此时A={0，4}满足要求；
若a=1，则4-a=3，此时A={1，3}满足要求；
若a=2，则4-a=2，此时A={2}不满足要求；
故有且只有2个元素的集合A有2个，
故选：C．