在果蝇幼虫时期,唾液腺染色体比其他细胞染色体大200多倍,并且是重复、倒位、易位、缺失等染色体畸变的好材料,唾液腺染色体上有明显的横纹,其相对大小和空间排列是恒定的,可以作为识别唾液腺染色体的标志.
唾液腺染色体是果蝇四对以上染色体以一定方式组成,而这些染色体是通过核内有丝分裂形成的多线染色体,因此一条染色体内含有染色线可以多达上千条,故也称巨大染色体.