因为当细胞内含有某种限制性内切酶时,细胞本身会有相应的保护措施.比如细胞基因组中没有该限制性内切酶能识别序列的序列(这种情况应该是比较少的)；主要的是细胞内能通过甲基化修饰来保护自身DNA不被自身限制性内切酶酶切.