A、小分子团水的分子与普通水分子相同，只不过它们的聚集状态不同，由于同种分子化学性质相同，故A错误．
B、分子，原子的性质包括质量小，体积小，总是在不断地运动；构成物质的微粒之间存在间隔，且间隔的大小与温度和压强有关，故B错误．
C、分子，原子的性质包括质量小，体积小，总是在不断地运动；构成物质的微粒之间存在间隔，且间隔的大小与温度和压强有关，故C错误．
D、本题所提到的小分子团水实际上是多个水分子的集合体，分子团水的分子与普通水分子相同，只不过它们的聚集状态不同，故它们的化学性质相同，物理性质不同，故D正确．
故选：D．