A、有氧呼吸的三个阶段都能产生ATP，A正确；
B、CO₂只是有氧呼吸第二阶段的产物，B错误；
C、H₂O只是有氧呼吸第三阶段的产物，C错误；
D、[H]是有氧呼吸第二阶段和第三阶段的产物，D错误．
故选：A．