海洋微生物就是以海洋水体为正常栖居环境的一切微生物.
海洋微生物以单细胞藻类和微小的多细胞藻类为主,其种类和数量是海洋微生物中最多的,也是构成海洋生态链的基础.
除了藻类外,各种细菌、多种酵母菌也都有.在海洋表层和近岸地区,海洋微生物最为丰富.在深海海底藻类种类和数量减少,细菌数量增加.在大洋中,细菌等微生物和种类和数量下降,主要是藻类.