超螺旋是最常见也是研究最多的DNA三级结构,DNA的三级结构是指在双螺旋结构基础上分子的进一步扭曲或再次螺旋所形成的构象,由于DNA双螺旋是处于最低能量状态的结构,如果使正常DNA的双螺旋额外的多转几圈或少转几圈,就会使双螺旋内的原子偏离正常的位置,这样在双螺旋分子中就存在额外张力.如果双螺旋末端是开放的,张力会通过链的旋转而释放,如果DNA分子两端是以某种方式固定的,这些额外张力就不能释放到分子之外,而只能在DNA分子内部重新分配,从而造成原子或基因的重排,导致DNA形成超螺旋.细胞内的DNA主要以超螺旋形式存在.