A、用³⁵S标记了噬菌体的蛋白质外壳．噬菌体侵染细菌过程中，蛋白质外壳留在细菌外面，所以在子代噬菌体中都不能找到³⁵S标记的蛋白质，A错误；
B、用³²P标记一个噬菌体的DNA，噬菌体侵染细菌过程中，DNA进入细菌内部，在细菌中以噬菌体DNA为模板，利用细菌的原料合成子代子代噬菌体的DNA，由于DNA复制具有半保留复制的特点，所以在子代噬菌体中能找到³²P标记的DNA，但只有2个含有放射性，B错误；
C、用³²P标记一个噬菌体的DNA，由于DNA复制具有半保留复制的特点，所以在子代噬菌体中能找到2个³²P标记的DNA，绝大部分不含³²P，C正确；
D、³⁵S标记了噬菌体的蛋白质外壳，在噬菌体侵染细菌过程中，蛋白质外壳留在细菌外面，DNA进入细菌内部，在细菌中以噬菌体DNA为模板，利用细菌的原料合成子代噬菌体的蛋白质外壳，则在子代噬菌体中都不能找到³⁵S标记的蛋白质，D错误．
故选：C．