in one's mind表示的是“想法,思想”
例如：in my mind,在我看来,在我的眼中
on one's mind表示的是“让某人为某事担忧”
例如：I've got a lot on my mind.有许多事让我操心.
也就是说,两种表达方式都有.
What's in your mind?你想什么呢?
What's on your mind?你愁什么呢?