在自然界中,基因突变、基因重组和自然选择都会影响基因频率的改变.基因频率的改变实质就是生物的进化过程,基因突变为进化提供原材料.
如果生物交配是随机的、自由的,每一个个体与种群内的其他异性个体交配的机会是均等的,而且后代没有死亡等,那么基因重组不会改变种群的基因频率.但事实上,这是理想条件,自然界不存在这种情况.生物之间的个体交配是不自由的,并不是每个个体与同种群内的其他个体的交配机会相等.有些个体交配的机会很多,而另一些个体没有交配机会.比如猴群中的猴王与猴群中雌猴交配机会很多,其他雄猴的交配机会减少,所以基因重组由于交配机会不均等,会造成某种基因传下去的机会很多,而其他基因传下去的机会减少,这样就会造成种群基因频率发生改变.