这个问题也很笼统阿.
所谓神秘,源于人类对事物的未知或者不了解所产生的感觉,正是因为人类对这个世界,大自然并不完全了解,所以说大自然是神秘的.
至于神秘在哪里,我觉得主要是说一些至今仍未能解释清楚的一些自然现象,（我所说的并非一些灵异现象）比如说球型闪电,地震的预测,金字塔等等..
详细了解可以百度搜索大自然现象.