on是最近的,表示毗邻,例如:London is on the river.伦敦紧挨着那条河.（"on”两个物体接触有一条线或一个面.
near在.附近,The city is near the sea.（"那个城市在大海附近".可能有一里地远.）
beside和by意思我认为没什么区别,在表示远近程度上.He is sitting by/beside me.（他正坐在我旁边.这个距离能用多大呢?）
at 表示就在这个点上.应该是零距离