Linux上的这些orf分别什么意思啊,
>comp1_c0_seq1_1_ORF1 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 1,threshold 1,41aa
ILNESHLYFQLSSLTTFVLCKGMLQHSNANPSLNWLFNGLG
>comp1_c0_seq1_1_ORF2 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 2,threshold 1,9aa
ITHPLDLRI
>comp1_c0_seq1_1_ORF3 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 3,threshold 1,66aa
NTVGRTPCHPYERICSCKQGILAAAREVHSSGHPGRCPHTLPPGSQVVSPCQFSSGWLHC
WSLFEI
>comp1_c0_seq1_1_ORF4 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 4,threshold 1,21aa
TSLVFLSDSHPPRTQPESLTF
人气:485 ℃ 时间:2020-03-28 11:24:50
解答
提问分类错误 这跟linux没有关系
orf是读框 这里命名不规则 不知道
41aa 是41个氨基酸您好,不是有六个读框么,用cat ,,,,,fasta 之后,出现比如>comp1_c0_seq1_1_ORF1 ,,,,>comp1_c0_seq1_6_ORF3,,,,一直到>comp1_c0_seq1_6_ORF12 ,从ORF1到12是什么。seq1-1到seq1-6,这应该是表示六个读框吗?在seq1—6中,又有seq1_6_ORF1到seq1_6_ORF12。从ORF1到12又是什么seq是不同序列 ORF是不同读框 。。。这样命名只有看说明档才知道他具体在写什么东西。。
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