Linux上的这些orf分别什么意思啊,
>comp1_c0_seq1_1_ORF1 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 1,threshold 1,41aa
ILNESHLYFQLSSLTTFVLCKGMLQHSNANPSLNWLFNGLG
>comp1_c0_seq1_1_ORF2 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 2,threshold 1,9aa
ITHPLDLRI
>comp1_c0_seq1_1_ORF3 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 3,threshold 1,66aa
NTVGRTPCHPYERICSCKQGILAAAREVHSSGHPGRCPHTLPPGSQVVSPCQFSSGWLHC
WSLFEI
>comp1_c0_seq1_1_ORF4 Translation of comp1_c0_seq1 in frame 1,ORF 4,threshold 1,21aa
TSLVFLSDSHPPRTQPESLTF
人气:347 ℃ 时间:2020-03-28 11:24:50
解答
提问分类错误 这跟linux没有关系
orf是读框 这里命名不规则 不知道
41aa 是41个氨基酸您好,不是有六个读框么,用cat ,,,,,fasta 之后,出现比如>comp1_c0_seq1_1_ORF1 ,,,,>comp1_c0_seq1_6_ORF3,,,,一直到>comp1_c0_seq1_6_ORF12 ,从ORF1到12是什么。seq1-1到seq1-6,这应该是表示六个读框吗?在seq1—6中,又有seq1_6_ORF1到seq1_6_ORF12。从ORF1到12又是什么seq是不同序列 ORF是不同读框 。。。这样命名只有看说明档才知道他具体在写什么东西。。
推荐
猜你喜欢
- 请问一下英语的句型是怎样的? 就是什么主语+谓语什么的!
- 拼音拼读怎么教
- 有"9v 3w"的灯泡1和"12v 6w"的灯泡2串联,电路中两端允许加的最大电压是多少?每个灯的电功率?
- 怎样说明"甲数除以乙数,等于甲数乘乙数的倒数"
- 英语翻译
- 小明行走的路程比小刚多4分之1,而小刚的行走时间却比小明多10分之1,小明和小刚的速度比是多少?
- a,b,c是三角形的3边,试判断方程 b平方乘x平方+(b平方+c平方-a平方)乘x+c平方=0是否有实数解,证明你的结论
- 定义@是一种运算符号,且a@b=a的b次方—b的a次方,试计算4@(3@2)的值