医疗领域：在目前这方面的研究受到极大的注目.像是干细胞应用于再生医学领域,如人工脏器、神经修复等.或是以蛋白质结构解析数据,对于功能性区域（domain）来开发相对应的抑制剂（如：酵素抑制剂）.利用微阵列核酸晶片,或是蛋白质晶片,寻找致病基因.或是利用抗体技术,将毒素送入具有特殊标记的癌细胞.或利用基因转殖技术,进行基因治疗等.基因治疗（gene therapy）利用分子生物学方法将目的基因导入患者体内,使之表达目的基因产物,从而使疾病得到治疗,为现代医学和分子生物学相结合而诞生的新技术.基因治疗作为新疾病治疗的新手段,给一些难治疾病的根治带来了光明.\x0d农学食粮：人口快速膨胀,食粮问题正是生物技术应用的切入点.在基因转殖农作物的开发下,除了转殖进入抗虫害基因、抗冻基因外,例如含有维生素A的稻米也问世.在有限耕地下,转殖农作物解决了品质上的问题.除此之外,观赏用的花卉等,也靠著组织培养的技术,将高品质的花卉复制生产,提高花卉价值.著名的像是台湾的蝴蝶兰.另外,经过遗传工程技术,能产生凝血因子的乳牛也提供医疗用途.生物肥料（biofertilizer）主要利用微生物技术制作的肥料种类.生物肥料不仅给作物提供养料、改善品质、增强抗寒抗虫害能力、还改善土壤通透性、保水性、酸碱度等理性化特性,可为作物根系创造良好生长环境,从而保证作物的增产.生物农药（biopesticide）利用微生物、抗生素和基因工程等产生有杀灭虫病效果的毒素物质,生产出广谱毒力强的微生物菌株制作而成的农药.它的特点有：1.不像化学农药般见效快,但效果持久.2.与化学农药比,害虫难以产生抗药性.3.对环境影响小.4.对人体和作物的危害性小.5.使用范围和方法有限制；等等.\x0d军事科技：基因工程武器（genetic engineering weapon）简称基因武器,例子有：插入眼镜蛇毒液基因的流感病毒和含有炭疽病毒的大肠杆菌.基因武器的特点是：1.生产成本低、杀伤力大、作用时间长.2.对方使用难发现、难预防、难治疗.3.使用方法简单,施放手段多.4.只伤害人,不破坏武器装备、设施.5.一旦使用会产生强烈的心理威慑作用.\x0d工业应用：在工业上,利用工业菌种的特殊代谢路径,来替代一些化学反应.除了专一性提高,也在常温常压下,节约能源.也由于专一性高,产生的废弃物量低,也因此被称为绿色工业.\x0d环境保护：当环境受到破坏,可以利用生物技术的处理方式,让环境免于第二次受害.生物具有高度专一性,能针对特殊的污染源进行排除.例如运输原油的邮轮,因事故,将重油污染海域,而利用分解重油的特殊微生物菌株,对于重油进行分解,代谢成环境可以接受的短练脂肪酸等,排解污染.此外,土壤遭受重金属污染,亦可利用特定植物吸收污染源.