A、图示细胞不含同源染色体，因此只含有A或a中的一种基因，A错误；
B、图示细胞不含同源染色体，因此只含有A或a中的一种基因，B错误；
C、该细胞只有a，且应分别位于姐妹染色单体上，不可能位于⑤和⑧上，C错误；
D、该细胞只有A，且应分别位于姐妹染色单体上，如分别位于②和⑥上，D正确．
故选：D．