A、基因组是指一种生物的全部不同基因所组成的一套基因．该选项符合题意．
B、基因型是性状表现的内在因素．该选项不符合题意．
C、位于一对染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基因就是等位基因．该选项不符合题意．
D、表现型是基因型的表现形式．该选项不符合题意．
故选：A．