方程x+3y=9，
解得：x=-3y+9，
当y=1时，x=6；当y=2时，x=3；
则方程x+3y=9的正整数解是

x=6 y=1

，

x=3 y=2

．
故答案为：

x=6 y=1

，

x=3 y=2

．