A、大豆属于被子植物，是植物；根瘤菌属于细菌，是菌类，故不符合题意；
B、小麦、玉米都属于种子植物中的被子植物、单子叶植物纲，亲缘关系较近．符合题意．
C、真菌属于菌类，与藻类植物亲缘关系较远，故不符合题意；
D、老虎属于哺乳动物，鲨鱼属于鱼类，虽然都属于动物，但亲缘关系较远，故不符合题意．
故选：B．