是的,都是分子水平!DNA和蛋白质都是生物大分子.
严格来说,前两者属于分子杂交技术（也算是基因工程原理吧）；第三个不属于基因工程,只是免疫学的一种实验技术.
不过,一般基因工程指的是：DNA分子重组技术.