我国南方和北方耕作类型、农作物有明显差异，北方平原广阔，耕地多，但热量较低，降水较少，以旱地为主，主要农作物是小麦；南方多丘陵、山地，但热量高，降水丰沛，以水田为主，主要农作物是水稻．因此导致南方和北方耕作制度差异的主要自然因素是气候条件．
故选：B．