首先,如果按你的表述氢氧根和氢氧根离子是同一种物质
OH-
氢氧根原子团实际上也和氢氧根一样,我猜你想问的应该是羟基
OH.
此原子团在有机化合物中称为羟基,是醇（ROH）、酚（ArOH）等分子中的官能团；在无机化合物水溶液中以带负电荷的离子形式存在（OH- ）,称为氢氧根（也称为氢氧根离子）.是的羟基一般用OH-横杠不是右上方的负号，代表化学键或者OH。黑点表示，
羟基 不带电，为电中性。
带电的原子团才会使用 “根” 这样的说法
氢氧根离子和氢氧根都是带一价负电 用OH-(负号在右上角)表示

如果你是初中生，没学过有机的话，那我认为它默认提到的全部是氢氧根离子。