细菌细胞大小的常用度量单位是微米（μm）,而细菌亚细胞结构的度量单位是纳米（nm）.
一个典型细菌的大小可用大肠杆菌作代表.它细胞的平均长度为2μm,宽0.5μm.迄今为止所知的最小细菌是纳米细菌,其细胞直径仅有50nm,甚至于比最大的病毒还要小.