先分析一下这个句子.谓语是is,is后面的都是表语.可以看出来you引导的是一个从句,因为缺少宾语,可见是这一个定语从句（不是表语从句,因为表语从句应该是一个完整的句子）,空中要填的就是定语从句的先行词.
能做先行词的只能是名词或代词 b.the one
你之所以认为which也可以,就是因为你对定语从句的句式不太熟悉：先行词+连接词+定语从句.其中的连接词就可以是which,that等.但必须有先行词,有了它,这个从句才可以叫定语从句（因为整个从句就是修饰这个先行词的）.
但选the one的话,先行词是什么呢?答案是,which或that,省略了.
所以整个句子：主语This museum ,谓语is,表语the one (它做先行词,被定语从句you visited a few days ago 修饰)