A、变压器的变压原理即为在同一个铁芯中磁通量的变化率相同，原副线圈的磁通量变化率相等，故A正确；
B、变压器只改变电压和电流不改变电流的频率，故B正确；
C、输入功率等于输出功率，故C正确；
D、电压与匝数成正比，原、副线圈中的感应电动势可以不同，故D错误；
本题选不相同的物理量，故选：D