A、要提高生态系统的稳定性，应控制对生态系统干扰的程度，A错误；
B、要提高生态系统的稳定性，应控制对生态系统干扰的程度，B错误；
C、能量传递效率是指能量在两个相邻营养级之间的传递效率，绿色植物的总能量至少有10%流入第二营养级，即流入兔、鼠、食草籽鸟和食草昆虫体内的能量至少占绿色植物总能量的10%，C错误；
D、流入兔体内的能量包括兔自身呼吸散失的能量，D正确．
故选：D．