根据题意可知，黄色皱粒（YYrr）与绿色圆粒（yyRR）的豌豆亲本杂交，产生的F₁植株的基因型为YyRr；该植株自花传粉产生的后代有：

9

16

黄色圆粒（Y_R_）：

3

16

黄色皱粒（Y_rr）：

3

16

绿色圆粒（yyR_）：

1

16

绿色皱粒（yyrr），其中绿色圆粒种子的基因型为

1

3

yyRR、

2

3

yyRr，绿色皱粒的基因型为yyrr，因此这两粒种子都是纯合体的概率=

1

3

×1=

1

3

．
故选：D．