选A
be going to表示打算干某事
意思:他打算在这儿呆多久?为什么不能用will he go?请说明原因，谢谢be going to和will都可以表示即将发生某事，但be going to还可以表示打算干某事，更强调的是一种主观愿望。而且如果选B 而成为 How long will he go to stay here? how long是对stay持续的时间提问的，而不是go to stay这个动作持续的时间提问的。