基和可形成负离子的羧基.因此,应用阳离子交换树脂和阴离子交换树脂均可对其进行分离和纯化.天然氨基酸主要来源于蛋白质水解液或微生物发酵液,随其来源不同,体系中氨基酸的含量与半生杂质的类型也有所区别,因而提取分离工艺也不尽相同.用于离子交换树脂从蛋白质水解液中提取分离氨基酸的工艺如下图：
而自然界中尚存在大量的非蛋白氨酸,具有药用价值的就有40余种.如美舌藻中的海人草酸、使君子种子中的使君子氨酸和南瓜子中的南瓜子氨酸,均具有驱蛔虫作用的中草药有效成分,均可用温水、乙醇或乙酸的水溶液提取,再用强酸性阳离子交换树脂进行富集和纯化而得到高纯度的产品.
混合氨基酸一般在阳离子交换树脂上分离纯氨基酸组分,其分离原理是基于树脂对不同氨基酸的选择性.选择性大小的顺序为：碱性氨基酸>中性氨基酸>酸性氨基酸.当解吸时,氨基酸流出顺序正好相反,酸性氨基酸最先流出树脂柱.决定氨基酸流出顺序的另外一个因素是氨基酸侧链的疏水性.