人工湿地脱氮的机理包括：植物和其他生物的吸收、氨化作用、硝化作用、反硝化作用、氨的挥发作用、铵根离子的阳离子交换作用等.人工湿地对磷的去除机理包括：基质吸附、植物吸收和微生物去除,而磷最终从系统中去除依赖于湿地植物的收割和饱和基质的更换.详见：湿地科学,2005年,第3卷,第3期,228-234页.