A、小肠绒毛上皮吸收氧气、甘油属于自由扩散，不需要消耗能量，故A错误；
B、小肠绒毛上皮吸收脂肪酸、水的运输方式是自由扩散，不需要载体和能量，故B错误；
C、小肠绒毛上皮吸收葡萄糖属于主动运输，吸收水为自由扩散，故C错误；
D、钾离子、氨基酸是通过主动运输，需要能量，而能量有细胞呼吸提供，呼吸酶抑制剂会抑制细胞呼吸提供能量，故会影响主动运输，故D正确．
故选：D．