A、由题意可知，让基因型为aaX^BX^B与AAX^bY杂交，则F₁为AaX^BX^b（红眼正常翅雌性）、AaX^BY（红眼正常翅雄性），A正确；
B、让F₁AaX^BX^b（红眼正常翅雌性）与AaX^BY（红眼正常翅雄性）相互交配，则F₂代雄果蝇的红眼基因来自F₁代的母方，B错误；
C、让F₁AaX^BX^b（红眼正常翅雌性）与AaX^BY（红眼正常翅雄性）相互交配，则F₂代雄果蝇中纯合子的比例

1

2

，杂合子的比

1

2

，所以F₂代雄果蝇中纯合子与杂合子的比例是1：1，C正确；
D、让F₁AaX^BX^b（红眼正常翅雌性）与AaX^BY（红眼正常翅雄性）相互交配，则F₂代雌果蝇正常翅个体：短翅个体=3：1，D错误．
故选：AC．