A、基因突变以后产生的基因可能是显性基因，也可能是隐性基因，A错误；
B、基因突变以后产生的基因可能是显性基因，也可能是隐性基因，B错误；
C、基因突变具有不定向性，往往突变为它的等位基因，C正确；
D、多数是有害的，但不是绝对的，有利还是有害取决于生物变异的性状是否适应环境，D错误．
故选：C．