已知它的一条单链上A1：G1：T1：C1=1：2：3：4，根据碱基互补配对原则可知，另一条链上A2：G2：T2：C2=3：4：1：2，因此该DNA分子中，A：G：T：C=1：2：3：4=2：3：2：3，则该DNA分子含有腺嘌呤脱氧核苷酸的数量是2000×

2

10

=400．因此该DNA分子复制一次，需要腺嘌呤脱氧核苷酸的数量是（2¹-1）×400=400个．
故选：C．