A、该生态系统的生产者是自养型鞭毛虫和大型植物，A错误；
B、该食物网由6条食物链构成，B错误；
C、在食物链和食物网中信息传递是双向的，所以信息在鲤鱼和梭子鱼之间双向传递，C正确；
D、鲤鱼在该食物网中占有二、三两个个营养级，D错误．
故选：C