A、由于新病毒的遗传物质是烟草花叶病毒的RNA，故感染后增殖出新的病毒为烟草花叶病毒，A正确；
B、以肺炎双球菌为实验材料进行的活体细菌转化实验，只能证明加热杀死的S型细菌含有某种转化因子，使R型细菌转化为S型细菌，B错误；
C、T₂噬菌体的DNA进入宿主细胞后，宿主细胞能合成出T₂噬菌体的外壳蛋白，并进行繁殖，说明DNA能够遗传并指导蛋白质合成，C正确；
D、通过基因工程，将外源DNA导入受体细胞后并整合到染色体上，随受体细胞稳定遗传，从而证明核酸是遗传物质，D正确．
故选：B．