A、基因工程的核心是基因表达载体的构建，故A错误；
B、单克隆抗体是骨髓瘤细胞和效应B细胞融合形成的杂交瘤细胞分泌的，故B错误；
C、来自同一胚胎的后代具有相同的遗传物质，胚胎分割可以看做动物无性繁殖或克隆的方法之一，则获得同卵双胞胎性别相同，故C错误；
D、蛋白质工程是以蛋白质的结构规律及其与生物功能的关系作为基础，通过基因修饰或基因合成，对现有蛋白质进行基因改造，或制造一种新的蛋白质，故D正确．
故选：D．