A、核糖体将氨基酸缩合成蛋白质，与杀死和消化分解病菌无直接关系，A错误；
B、线粒体是进行有氧呼吸的主要场所，与杀死和消化分解病菌无直接关系，B错误；
C、中心体与有丝分裂有关，与杀死和消化分解病菌无直接关系，C错误；
D、溶酶体内含有许多种水解酶，能杀死和消化分解病菌，D正确．
故选：D．